让 AI 写一串 DNA 不难,难的是让整串 DNA 真能“活起来”。这项被 Science 收录的研究,把聊天模型续写文字的思路用到完整噬菌体基因组:研究团队以小型裂解型噬菌体 ΦX174 为模板,用 Evo 1 和 Evo 2 生成候选 DNA。噬菌体是专门感染细菌的病毒;基因组语言模型则把 A、C、G、T 当作文字,学习哪些序列组合可能协同工作。
最值得注意的是从电脑生成到实验存活的跨越。据 Arc Institute 介绍,团队合成测试了 285 个设计,最终得到并经测序确认的 16 个可存活噬菌体。它们能感染非致病的 E. coli C 和近缘的 E. coli W,却未在另外六个受测菌株上生长,说明实验中仍保留了受限的宿主嗜性——也就是病毒“能开哪些细菌的锁”。每个可用基因组相对最接近的天然基因组带有 67 至 392 个新突变。论文作者还称,部分生成噬菌体在生长竞争和裂解速度上超过 ΦX174。样本规模仍小,效果也主要来自团队自述,但这已把生成式生物设计从单个零件推向了整段可运行基因组。