想找出一群人里谁在影响谁,只看几张合照很难;如果同时观察每个人一段时间内的动作、表情和说话节奏,线索就多了。基因网络推断也类似:研究者要从分子信号随时间变化的曲线,反推哪些基因可能激活或抑制另一些基因。Haitao Zhang 等人在 JASA 提出的 ML-ODE,正是为同时利用多种测量而设计。
它把常微分方程——用“当前状态决定下一刻变化速度”描述动态系统的工具——与多线性映射结合,处理同一对象上的多模态函数数据,例如不同类型分子信号的整段时间曲线。方法里最关键的一步,是为每种模态各设一套“基底”,也就是用一组基本曲线统一表示数据和作用关系,再把原本难处理的动态反推问题转成代数优化。作者还定义了 ODE 系统何时具有“可推断性”,并证明 ML-ODE 在一定条件下满足这一性质。模拟之外,团队将它用于造血干细胞的真实多模态数据;作者称所得网络可由相关文献支持,但材料未披露具体准确率或比较数字。